ява енкодеров нет, если обфускаторы, которые затрудняют процесс визуального чтения.
и существуют два вида обфускаторов:
первый вариант использует eval()
второй - document.write
обычно присутствует длинаая строка с разными символами, потом мелкая функция которая выбирает из символов исполняемый код и третья строка - засылка исполняемого кода в браузер.
вот именно здесь и нужно менять eval() или document.write на alert()