При установке FF спрашивает, использовать куки/темпорари уже устанонвленных браузеров (IE,Opera) или создать свои. Наверное он также поступает относительно мозилы.
Куки свои для каждого профайла (в фф - точно). Если у тебя используется один и тот-же профайл (не знаю возможно-ли это) - то будут одни. Если разные профайлы - разные куки.
