apachectl -S
Должен показать все настроенные virtual hosts, если нет, то смотри все ли правильно подключено, что пишет в error_log, права на файлы конфигурации
проверь права на доступ апача на чтение папки с вирт хостами. была такая же проблема..оказалось на папке /home/ права были 600 и апач не мог достучатся