Не работает bash-скрипт написанный в винде

Какая-то странная проблема, которая не поддается моему логическому осмыслению. Есть скрипт написанный на powershell, который в свою очередь генерирует последовательность команд консоли и создает bash-скрипт (кодировка utf-8). Потом получившийся файл обрабатывается утилитой dos2unix, чтобы вычистить \r, потом заливается на linux-сервак по ftp и успешно там не работает выдавая всякую дрянь. Понимаю что дело в кодировке, но что конкретно не понимаю. Конечно вряд ли, но может кто подскажет куда копать?

Сюр, конечно, но некоторые фтп-серверы при передаче в режиме ascii самостоятельно что-то перекодируют, обрезают строки итд. Попробуй binary.

SFTP (ssh file transfer protocol) пробовал, теже вилы.