я ставил несколько WP 3.0 на nginx (правда до выхода официальной версии стояли 3.0 RC1, т.е. полуается апдейт был до полной 3.0 при выходе). никаких проблем не было. напиши подробнее что происходит при установке?
доспуп к серверу есть? в логах nginx (или в логах вирт. хоста домена) что нибудь видешь?