суммы в transactions и check amounts должны совпадать ?
Нет, не совпадают. Трансфер кост: 0.44$ + некоторые партнерки делят на пополам с адвертами CCBill fee. Подробнее тут можешь почитать FAQ по CCbill.
И плюс еще если есть рефералы, то реферальные в transactions не отображаются.