Как вариант: сделай из этого ротатора полный экспорт со всеми данными (включая thumbs_path/array и т.д.).
Потом сделай новый ротатор и перенеси туда всё из того, в котором будешь размер тумб менять. Ротатор станет пустой, можно будет в опциях размеры тумб изменить, а потом через импорт вставь в него то, что экспортнул. Стрим должен автоматом размер поменять из экспортируемых тумб.
я скачивал все тумбы, потом переделывал (по батчу фотошопа) и заново заливал.
и менял для ротатора размеры тумб в мускуле (если кому интересно таблица: rotation_zones, поле: rotation_zone_thumb_width ...)