Пользуюсь давно. Честно говоря считал что фар портейбл видно ошибался. при запуске этого же фара с другой машины в разделе фтп не вижу своих букмарков - где он их хранит?
В реестре: [HKEY_CURRENT_USER\Software\Far\Plugins\FTP]
В папке FAR'а лежит файл "SaveSettings.bat". Запусти его. Результатом его работы будет два файла: "FarSave1.reg" и "FarSave2.reg". Перенеси их на нужную машину в папку FAR'a и запустите "RestoreSettings.bat"