Если сменить индекс?
те был index.shtml а стал index.php
допустим без изменения контента
они склеятся сами или чего-то сделать нужно чтоб они склеились?
кто пробовал, отпишитесь плс...
Если главная страница открывалась всегда через / и index.shtml нигде не засвечен (т.е. в гугле и пр. нет явной ссылки domain.com/index.shtml), то разницы никакой.
В противном случае хорошо бы в index.shtml сделать Permanent Redirect на новый индекс index.php. Вот тут несколько способов: http://www.somacon.com/p145.php.
еще вариант насколько я помню - сделать обработку shtml файлов как php файлов и оставить shtml
Но не уверен что это возможно (сужу просто по аналогии сделать html обрабатываемым как shtml, это можно 100% без смены расширений)