Минусы:
1. Ограниченность поддерживаемых гостевых ОС. Virtuozoo Containers запускается на Linux и Windows и в зависимости от платформы, поддерживает либо только Linux-дистрибутивы, либо только OS Windows. VDS Manager поддерживает в качестве гостевых ОС только Linux/FreeBSD.
2. Жесткая ограниченность памяти. Доступная оперативная память для виртуального окружения может быть жестко или мягко ограничена и за пределы в пиках трудно «выпрыгнуть». В то время как в средствах аппаратной виртуализации можно настроить в виртуальном окружении своп. В виртуализации уровня ОС свопа нет.
3. VDS на основе Virtuozzo Containers или VDS Manager обычно стоят дороже, чем к примеру VDS на основе Xen.

Аппаратная виртуализация.

Преставлена такими решениями как VmWare, Xen.

VmWare – коммерческий продукт, рассчитанный более на производственное использование, нежели на организацию VDS хостинга. Хотя массовый хостинг на нем все таки можно организовать.

Xen – Open Source разработка кембриджского университета. Довольно перспективная технология, набирающая в последнее время хорошую популярность.

Плюсы данных технологий по сравнению с виртуализацией уровня ОС:
1. Более широкая поддержка гостевых систем
2. Эмуляция практически настоящей выделенной машины
3. Возможность создания свопа для компенсации безотказных пиков потребления памяти.
4. Виртуальные сервера на основе Xen обычно дешевле аналогичных предложений по коммерческим решениям вроде Virtuozzo, VmWare.

Минусы
1. Более низкая производительность
2. Отсутствие удобных GUI для управления виртуальным сервером